HIFU治疗子宫腺肌病的过程中病灶坏死可能引起疼痛，具体疼痛程度跟病灶的大小、位置及患者对疼痛的耐受程度等相关。治疗过程中给予镇静镇痛药物治疗，绝大部分患者感觉治疗过程舒适无痛苦，或仅为轻微可忍受程度的疼痛，一般治疗结束后疼痛即可消失。